Сред по-известните заглавия във филмографията на актьора се нареждат „Офицери и пешки” на Робърт Редфорд с Том Круз и Мерил Стрийп; „Световния търговски център” на Оливър Стоун; „Момиче за милион долара” на Клинт Истууд с Хилари Суонк и „Вавилон” на Алеха
Майкъл Пеня се утвърждава с широк спектър от роли под режисурата на именити и талантливи творци. Пеня получава признание за ролята си в отличения с редица награди, включително и Оскар, „Сблъсъци” на Пол Хагис. Заедно с останалите актьори от филма, сред които Дон Чийдъл, Терънс Хауърд, Мат Дилън, Брендън Фрейзър и Сандра Бълок, Пеня получава награди за най-добро колективно изпълнение от Гилдията на филмовите актьори и Асоциацията на телевизионните кинокритици.
През последната година Пеня работи по Everything Must Go с Уил Фарел и Ребека Хол. Снима се също така в черната комедия The Good Doctor заедно с Орландо Блум.
Междувременно Пеня вече втори сезон е част от екипа на сериала „На изток и надолу” с участието на Дани Макбрайд. Двамата ще участват заедно и в „30 minutes or less” на режисьора Рубен Флайшър, в който си партнират с Джеси Айзенбърг.
Пеня е част и от екипа на предстоящия „Адвокатът с Линкълна” по едноименния роман на Майкъл Конъли, в който участват още Матю Макконъхи, Райън Фелипе, Мариса Томей и Уилям Мейси.
Сред по-известните заглавия във филмографията на актьора се нареждат „Офицери и пешки” на Робърт Редфорд с Том Круз и Мерил Стрийп; „Световния търговски център” на Оливър Стоун; „Момиче за милион долара” на Клинт Истууд с Хилари Суонк и „Вавилон” на Алехандро Гонзалес Инариту.