Тобиас Винсънт Магуайър е роден на 27 юни 1975 г. в Санта Моника, Калифорния, САЩ. Родителите му не са били женени, когато се е родил, като майка му е била на 18, а баща му на 20 години. Баща му Винсънт е бил готвач и от време навреме строител.
Майка му Уенди е била секретарка, амбицирана да се занимава със сценаристика. Двамата се разделят през 1977-ма. Това води до непрекъснати местения и пътувания между Калифорния, Орегон и Вашингтон. Тоби напуска училище в девети клас и започва да се снима. Вегетарианец е и се интересува от йога. Участва в реклами и получава малки роли в различни телевизионни шоупрограми.
Първата му по-сериозна изява е в комедията на Fox "Great Scott!" (1992). Тя се излъчва в продължение на девет седмици, след което заради нисък рейтинг е свалена от ефир. Магуайър прави своя дебют на широкия екран в „Животът на момчето” (1993). Четири години по-късно се снима при Уди Алън в „Да разнищим Хари” и в “Ice Storm” при Анг Лий, след което снимачната програма на Тоби бързо става натоварена.
На следващата година играе в „Страх и омраза в Лас Вегас” (1998) на Тери Гилиам и в „Плезънтвил” (1998), а през 1999-та играе до красивата Чарлийз Терън в „Правилата на играта” на Ласе Халстрьом и в „Ride with the Devil” (1999) отново при Анг Лий. 12 месеца по-късно партнира на Майкъл Дъглас в слабия „Момчета-чудо” (2000) През 2002-ра подписва договор за участие в първия филм от поредицата за Спайдър-мен. През 2003 г. се снима във „Воля за победа, в който застава рамо до рамо с Джеф Бриджис и Крис Купър.
Следва „Спайдър-мен 2” (2004), а през 2007 се снима и в третия филм за Човека-паяк. Междувременно успява да се появи в лентата на Стивън Содърбърг „Добрият германец” (2006). След участието му в „Brothers” ще го чакаме в „The Details” (2010) с Лора Лини, Елизабет Банкс и Рей Лиота.